浦东病原微生物宏基因组 mNGS 检测
适用人群
对比传统培养与靶向PCR,宏基因组mNGS一次检测覆盖31,033种病原体,3天出具报告,解决常规检测阴性但临床高度怀疑感染的难题。
适用人群
- 重症肺炎患者,常规抗生素治疗3天无效需快速明确病原
- 不明原因发热(FUO)患者,血培养、影像学等常规检查无病因
- 免疫缺陷患者(如HIV、化疗后)疑似机会感染,难培养病原可能
- ICU复杂感染患者,病情进展迅速,等不及传统培养周期
- 疑似中枢神经系统感染患者,脑脊液常规阴性但临床高度怀疑
- 菌血症或败血症患者,血培养阴性但感染指标持续异常
检测内容
本检测采用宏基因组高通量测序(mNGS)技术,对样本中全部微生物的DNA和RNA进行无偏倚测序。与传统培养仅覆盖单一或少数病原体不同,本检测覆盖31,033种微生物:包括细菌14,208种(含104种分枝杆菌)、真菌814种、病毒15,720种(DNA病毒12,894种+RNA病毒2,826种)、寄生虫169种、支原体/衣原体97种、螺旋体25种。同时可检测4,417种耐药基因(覆盖31种抗生素)和484种毒力基因。这意味着即使病原体丰度低、难培养(如分枝杆菌、立克次体),或为RNA病毒(如新冠、流感),也能被检出。但需注意:不能区分定植与致病,部分新发病原可能漏检,结果需结合临床综合判读。
检测流程
采样便捷,无需空腹。根据感染部位选择样本类型:血液(外周血2-5mL)、痰液、肺泡灌洗液、脑脊液、尿液、分泌物等。本地医院或诊所可完成采样,样本常温保存,通过专业冷链物流寄送至检测实验室。全程仅需一次采样,无需患者反复奔波。
准确性说明
检测基于宏基因组测序技术,不依赖病原体分离培养,直接对核酸进行测序,减少了培养环节的假阴性。阴性质控样本的严格质控流程可评估环境污染和试剂背景,降低假阳性。阳性结果提示病原体存在,但需结合临床症状、影像学、炎症指标综合判断是否为真正病原;阴性结果不能完全排除感染,可能因采样时机不当、抗生素治疗后病原载量过低或为新发病原。检测结果由《ABX指南》和《临床微生物学手册(第11版)》指导解读,确保专业准确。
详细流程
- 临床医生评估患者是否符合mNGS适用场景(重症/疑难/不明原因发热)
- 根据感染部位选择合适的样本类型(血液/肺泡灌洗液/脑脊液等)并完成采样
- 样本由医院或诊所送至当地合作物流点,冷链运输至检测实验室
- 实验室接收样本后进行前处理(裂解病原细胞壁)
- 提取核酸(DNA+RNA),合成cDNA确保RNA病毒可检出
- 片段化、文库构建,上机进行高通量测序
- 生物信息学分析,比对31,033种微生物数据库及耐药/毒力基因库
- 报告生成(3个工作日内),由专业团队解读并返回临床
检测须知
- 本检测不适用于普通感冒或自限性感染,临床主要用于重症、疑难、免疫缺陷患者
- 采样前无需空腹,但应避免样本污染(如痰液需深咳获取)
- 检测结果需结合临床症状、影像学和其他实验室检查综合判断,不可单独作为诊断依据
- 阳性结果需区分定植与致病,低reads病原体需谨慎评估
- 阴性结果不能完全排除感染,可能因病原载量过低或新发病原
- 检测价格相对传统培养较高,应作为临床决策辅助而非常规筛查
常见问题
Q: 我发烧一周了,查不出原因,适合做这个检测吗?
A: 您的情况属于“不明原因发热”,非常符合本检测的适用场景。mNGS 能一次性筛查 31,033 种病原体,包括常规血培养和 PCR 查不到的罕见病原,比如立克次体、分枝杆菌等。报告周期仅 3 天,能帮助临床快速锁定病因,尤其适合常规检查阴性但高度怀疑感染的患者。
Q: 我父亲在浦东ICU,因重症肺炎上呼吸机,用了多种抗生素没好转,痰培养一直阴性,这个检测能帮上忙吗?
A: 非常适合ICU复杂感染。常规培养在抗生素使用后阳性率显著下降,而mNGS受抗生素影响较小。本检测覆盖31,033种病原体,包括真菌814种、病毒15,720种,还能检出4,417种耐药基因,指导精准用药。报告周期仅3天,比传统培养更快,适合病情进展迅速的重症患者。
Q: 这个检测能发现像新冠、流感这样的RNA病毒吗?
A: 能。本检测采用DNA+RNA同时检测模式,通过cDNA合成步骤将RNA病毒逆转录后进行测序,因此可以检出新冠、流感、HIV等RNA病毒。同时,它也能检出DNA病毒(如巨细胞病毒、EB病毒),覆盖15,720种病毒(含DNA病毒12,894种,RNA病毒2,826种),适合不明原因发热或疑难病例的鉴别诊断。
Q: 我在浦东,检出‘耐药基因’但没做药敏,能直接换药吗?
A: 不能直接换药。本检测覆盖4,417种耐药基因(对应31种抗生素),可提示耐药风险,但不等同临床药敏结果。例如检出aph(3')-IIa提示氨基糖苷类耐药,具体用药需医生结合临床、药敏试验综合判断。mNGS是辅助决策,不能替代传统药敏。
Q: 我采样后3天拿到报告,下一步该找谁解读?
A: 报告出具后,建议您首先咨询送检医生,他们会结合您的临床症状、影像学和其他检查结果综合判断。我们的报告解读依据《ABX指南》和《临床微生物学手册(第11版)》,但最终治疗方案需由临床医生决定。如需二次意见,可携带报告到专科医院感染科或呼吸科咨询。