浦东BRCA1/2基因检测
适用人群
对比单一BRCA检测,本品通过BRCA1/2全外显子±20bp测序联合HRD评分≥43分,多提供50%PARP抑制剂获益人群,避免漏检。
适用人群
- 卵巢癌患者考虑PARP抑制剂一线维持治疗,需明确HRD状态者
- 乳腺癌患者尤其是三阴性或HER2-,需区分胚系/体细胞BRCA突变
- 胰腺癌或前列腺癌患者,需评估gBRCA突变指导靶向治疗
- 家族中有多人乳腺癌/卵巢癌,需遗传风险分层而非仅筛查单一基因
- 已做BRCA检测阴性但临床高度怀疑HRD通路异常的肿瘤患者
- 需同时获得用药决策和家族遗传风险评估,不想分两次检测者
检测内容
本产品采用高通量测序(NGS)技术,检测BRCA1/2基因全外显子及上下游各20bp内含子区域,覆盖点突变(SNV)、小片段插入缺失(INDEL)、拷贝数变异(CNV)三种突变类型。同时,额外检测基因组不稳定性评分(HRD score),综合评估杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因不平衡(TAI)、大片段迁移(LST)三个指标。HRD阳性定义为存在BRCA致病/可能致病变异或HRD score ≥43分。不同于仅检测BRCA1/2的常规项目,本品能识别因其他同源重组修复基因异常(如PALB2、RAD51等)导致的HRD阳性患者,这部分人群约占卵巢癌患者的20%,单一BRCA检测会漏掉。局限性:对大片段倒位、复杂重排、嵌合体变异灵敏度有限,不涉及RNA或蛋白水平检测,变异解读随数据库更新可能变更。
检测流程
样本采集仅需蜡块(肿瘤组织)和血液(白细胞)双样本,无需空腹或特殊准备。蜡块从原医院病理科调取即可,血液样本可在当地医院或合作采血点完成。支持全国邮寄方案,样本常温稳定运输48小时。在浦东本地,我们提供上门采样或指定三甲医院合作窗口,全程冷链物流至中心实验室,从样本签收到出具报告常规7-15个工作日,加急可缩短至4个工作日(如原报告样例所示)。
准确性说明
NGS技术对BRCA1/2全外显子区域测序深度≥500X,SNV/INDEL检测灵敏度>99%,CNV检测分辨率达外显子水平。金标准设计:蜡块(肿瘤组织)+白细胞(胚系对照)双样本对比,可明确区分体细胞突变与胚系突变,避免遗传风险误判。HRD评分采用国际公认的LOH/TAI/LST三指标综合算法,临界值43分经临床验证。阳性结果(BRCA突变或HRD score≥43)提示PARP抑制剂高度获益,阴性结果(无突变且HRD score<43)则获益有限,需结合其他治疗。胚系变异阳性者,需进一步家系验证和遗传咨询。
详细流程
- 临床医生评估患者适应证(卵巢癌/乳腺癌/胰腺癌/前列腺癌等)
- 在浦东合作机构或线上预约,签署知情同意书
- 采集蜡块切片(原医院病理科调取)+ 外周血5ml(EDTA抗凝管)
- 样本冷链寄送至中心实验室,核对信息并质检
- DNA提取、文库构建、NGS测序(BRCA1/2全外显子±20bp)
- HRD评分算法分析LOH/TAI/LST,综合判读
- 生信分析区分胚系vs体细胞变异,注释致病性
- 出具报告(常规7-15个工作日,加急4天),医生解读结果
检测须知
- 蜡块需为3年内保存的福尔马林固定石蜡包埋组织,避免脱钙处理
- 血液样本需与肿瘤组织配对送检,单送血液无法完成HRD评分
- 本检测仅针对DNA水平,不涉及蛋白或RNA层面,变异解读以当前数据库为准
- HRD评分临界值43分基于本产品验证,不同平台阈值可能不同
- 极少数样本因DNA质量不足(如蜡块过久)可能导致检测失败
- 检测结果需结合临床病理、影像及家族史综合判断
- 胚系阳性变异需经Sanger测序验证,并建议一级亲属检测
- 变异分类可能随中国人群数据库更新而变更
常见问题
Q: 我母亲有乳腺癌病史,我自己需要做这个检测吗?
A: 如果您母亲携带BRCA1/2胚系致病突变,您作为一级亲属有50%的概率遗传该突变。本检测可明确您是否携带遗传性BRCA变异,评估乳腺癌、卵巢癌等终身患病风险。建议先确认您母亲的检测结果,若为阳性,您再考虑检测。若母亲未检测,您也可直接检测作为风险评估依据。
Q: HRD评分涉及哪些基因组指标?具体怎么算?
A: HRD评分综合参考3个指标:杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因不平衡(TAI)和大片段迁移(LST),综合计算出一个分数,全面反映基因组瘢痕状态。本检测以HRD score ≥ 43分为阳性界值。
Q: 报告中HRD的三个指标LOH、TAI、LST具体数值怎么看?
A: 这三个指标是HRD评分的组成部分:LOH(杂合性缺失)、TAI(端粒等位基因不平衡)、LST(大片段迁移),综合计算得出基因组不稳定性评分(HRD score)。本检测以HRD score≥43作为阳性判读标准,三个单项指标数值本身不单独用于临床决策,仅作为内部算法参考。
Q: 我是乳腺癌患者,报告BRCA2胚系突变,能用他拉唑帕利吗?
A: 根据产品资料,他拉唑帕利(Talazoparib)的FDA适应症为gBRCA阳性的HER2-转移性乳腺癌。您的报告显示BRCA2胚系变异,符合用药前提。但需确认HER2状态为阴性,且为转移性阶段。建议您将报告提交给肿瘤科医生,结合病理和临床分期,判断是否适合使用。本检测仅提供分子诊断依据,用药决策需医生综合评估。
Q: 我拿到了纸质报告,但上面有看不懂的英文缩写,能解释吗?
A: 当然可以。主要缩写的含义:HRD=同源重组缺陷,LOH=杂合性缺失,TAI=端粒等位基因不平衡,LST=大片段迁移。HRD score≥43分或存在BRCA致病/可能致病变异即为HRD阳性,提示PARP抑制剂可能获益。您也可以拨打报告上的客服热线,提供报告编号,我们安排遗传咨询师一对一解读。